Che poi non si tratta nemmeno di una penale, sarebbe molto interessante discutere di che tipo di clausola si tratti.
Pare quasi un inadempimento del passeggero/acquirente, sanzionato ex ante con la liberazione del controdebitore (la compagnia aerea) dalla propria obbligazione (il trasporto).
Un pò come se l'effettuare la prima tratta facesse parte della prestazione del consumatore.
Se avete altre idee su come altro qualificare questa clausola potrebbe nascerne una discussione interessante.
Ho pensato la stessa cosa: il viaggiatore si obbliga ad utilizzare il servizio di trasporto, e la mancata fruizione di una parte del servizio costituisce inadempimento essenziale che comporta la risoluzione del contratto.
A seguito della risoluzione ipso facto il vettore non è più tenuto ad eseguire la parte restante della propria prestazione ma ha diritto a trattenere il prezzo totale (non le tasse), direi a titolo penale se non vengono idee migliori.
Non mi pare una clausola particolarmente vessatoria vista la complessità del mercato del trasporto aereo. (Può comunque esserla ai sensi del CC.)