Perchè è un interline. Così come un passeggero può acquistare tramite canali AZ un CTA-FCO (AZ) e un FCO-HKG in connessione con CX ma non il solo FCO-HKG. Dipende da che tipo di accordo c'è tra i vettori.
Strano però che ci sia una cosa simile tra LH e KM che sono della stessa alleanza.
Air Malta non è in nessuna alleanza e l'accordo con LH per quel volo è di c/s.
Quindi l'unica possibilità è che LH non voglia occuparsi della commercializzazione del FCO-REG o non possa occuparsene perché AirMalta vuole l'esclusiva sul traffico p2p.
Con l'aggiunta del codice LH sia aggiunge la possibilità anche degli interline di LH.
Quindi un REG-FCO-BKK con Thai sarebbe possibile anche senza un accordo diretto AirMalta-Thai ma usando quello (presumibilmente) già in essere con LH.
Non ci è mai stata; controlla tu stesso
http://www.staralliance.com/en/about/airlines/
PS: è ben diverso essere "Partner di LH" o in Star Alliance.
